腫瘤浸潤淋巴細胞可作為新的抗PD-1療效的泛癌預測生物標志物
2021-02-27 21:53
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最后，為了驗證上述結論，分析了應用PD－1／PD－L1或CTLA－4治療的患者的數據集，觀察到高淋系和TIL評分與更好的無進展生存有關（圖5A，B）。在另一個隊列中也證實在轉移性黑色素瘤的抗CTLA－4治療中，高淋系和TIL評分與更好的無進展生存有關（圖5C，D）。在另外兩個應用PD－1／PD－L1療法的隊列中，高淋系評分也與更好的結果有關（圖5E，F）。使用AUC作為評估標準，可發現基于淋系評分或TIL評分比經典signature（如EIG或免疫浸潤）預測患者預后的性能更好（圖5G－J）。接下來對兩個隊列中將TIL和淋巴評分與IMPRES、IPS和TIDE進行比較（圖5G、H）。TIL評分在Dijon－Montreal隊列中表現最好，但在Van Allen隊列中表現最差，淋系評分表現則較為穩定。值得注意的是，在GSE數據中，因為相關基因表達數據缺失，TIL評分、IMPRES、IPS和TIDE無法被計算。
圖5A－F．TIL和淋系評分高與低的患者無進展生存期的差異；圖5G－J．基于TIL評分、淋系評分、CD3E、IPS、IMPRES以及TIDE在不同數據中對患者預后的預測性能
小結
在本篇學習筆記中提出了多種不同的可用于預測腫瘤預后的評分方法，通過泛癌分析，相關分析，LASSO模型等手段探究了這些評分之間的關聯以及各自適用的范圍，最終證明了基于40個基因的TIL評分以及其中包含的基于10個基因的淋系評分在腫瘤預后和免疫治療療效中的預測價值，而40或10個基因的模型相比于先前的模型體量也相對較小，更有臨床應用的價值。
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